備忘録 a record of inner life

やったことや考えたこと・本・論文・音楽の備忘録。 特に環境科学・生態毒性に関して。

因果探索

論文のメモ: 因果探索手法の有効性の検証~サンプルサイズと仮定からの逸脱との関係~

Prakash S, Xia F, Erosheva E, 2024, A Diagnostic Tool for Functional Causal Discovery, arXiv:2406.07787. 観察データから因果の向きを推定する因果探索(causa discovery)の手法であるLiNGAM(Linear Non-Gaussian Acyclic Model)が、2変量の因果の…

論文のメモ: AOPと因果推論

AOP(Adverse Outcome Pathways)は、分子レベルから個体・個体群レベルの生物影響をつないで、化学物質の悪影響を整理する枠組みです。そのAOPと因果関係、因果推論についての話。 Spînu N, Cronin MT, Madden JC, Worth AP, 2022, A matter of trust: lear…

論文のメモ: 遺伝子発現解析と因果探索(IDA・PCなど)

Maathuis MH, Colombo D, Kalisch M, Bühlmann P, 2010, Predicting causal effects in large-scale systems from observational data, Nature Methods 7(4): 247-248. 変数間の因果関係が分からないときに因果効果を求める方法。Intervention-calculus when…