Sampurna, B. P., Audira, G., Juniardi, S., Lai, Y. H., & Hsiao, C. D. (2018). A simple imagej-based method to measure cardiac rhythm in zebrafish embryos, Inventions 3(2): 21.
マジのメモ。Image Jで動画を取り込んで、心拍数のデータを取得する簡単な方法。ほぼTime Series Analyzer（ﾘﾝｸ）というpluginを使用するだけですので、ざっといくつかのツールや論文を見た感じだとこれが最も簡易な方法の一つです。心臓部分を囲って、Time Series AnalyzerのプラグインからAddとGet Averageを押すだけ。
この論文では心房と心室を分けていますが、もちろん分けなくても解析は可能です。ただその場合は若干汚い時系列データになるかも。
