論文「混合物と地下水がオオミジンコの転写産物に与える影響の評価」

論文生態毒性分子生物学 Mixtures

環境中にある有害物質が1つの物質単独で存在することは非常にレアなケースです。多くは、複数の有害物質が同時に存在しています。そのように複数の有害物質が混在する際の毒性影響は、物質が単一で存在する場合の毒性影響と異なるのでしょうか。例えば単一…

2015-01-29

論文「湖沼底質の有機汚濁物質がDaphniaの休眠卵からの孵化に影響する」

論文生態毒性個体群

Daphniaの乾燥卵殻 (dried ephippium) を、Greifensee湖の底質に曝露させてみた研究。15日間でのふ化率は、曝露させた系での方が高かったようです。ちょっと意外な結果でしたが、ストレスのある環境で卵のまま死んでしまうのを防ぐために早くふ化する戦略を…

2015-01-29

Rを用いた絶滅確率のモンテカルロシミュレーション

生態系 R言語

メモ。統計ソフトRを使って、個体群の絶滅確率を計算する関数を考え中。 n回繰り返しを行って、そのうち絶滅した回数を数えればよい。 f <- function (n) { count <- 0 for (i in 1:n) { # 1~nの値をとりながら{}内を繰り返す if (絶滅する条件) count <- co…

2015-01-28

論文「Ni, ZnのDaphniaへの複合影響は、影響の度合いによって相乗的になったりならなかったりする」

論文生態毒性重金属 Mixtures

ETCから来た新着論文のアラートにあったもの。まだ要旨しか見れないけど、面白そうだったのでメモしておきます。影響レベルの高い物質・濃度同士を組み合わせると相乗効果だが、影響の低い物質・濃度同士ならば濃度加算モデル(CA model)で説明できる、という…

2015-01-27

論文「ゼブラフィッシュと水浄化技術：有害な都市排水の対策としてのバイオリテンション」

論文生態毒性ノンポイント汚染

路面排水の生態毒性評価に関する論文。具体的な毒性低減策と結びつけた研究はあんまり見たことがなかったので、メモ。高速道路で採取した路面排水を土壌カラムに通して、ゼブラフィッシュの毒性試験をおこなったもの。 McIntyre J.K., Davis J.W., Incardona…

2015-01-22

論文「転写産物の次世代シーケンス：非モデル動物におけるRNA単離ガイド」

論文分子生物学

前回に続きRNA固定・抽出のTips論文。次世代シーケンサーの発展により、ショウジョウバエやマウスのようなモデル生物以外の生物種でもRNA抽出をおこなうことが増えました。モデル生物で確立されたRNA抽出法・前処理法を、他の生物にそのまま適用しても上手…

2015-01-20

論文「水生甲殻類RNAの簡易迅速な固定法」

論文生態毒性分子生物学

RNA固定のTips論文。 Heckmann L-H et al., 2007, A simple method and rapid method for preserving RNA of aquatic invertebrates for ecotoxicogenomics, Ecotoxicol., 16, 445-447. Daphniaなどの水生生物のRNA固定をおこなうとき、水を除去するのが困難…

2015-01-19

論文「甲殻類の慢性試験から推定した個体群増加率の感度解析」

論文生態毒性個体群

前回の投稿に続き、個体群の話。あんまりちゃんと読んでないです。 Meyer J.S., Ingersoll C.G. and McDonald L.L., 1987, Sensitivity analysis of population growth rates estimated from cladoceran chronic toxicity tests, Environ. Toxicol. Chem., 6…