Xiong B, Yang Y, Fineis FR, & Wang JP, 2019, DegNorm: normalization of generalized transcript degradation improves accuracy in RNA-seq analysis, Genome Biol 20(1): 1-18.
RNAの分解度の指標であるRIN（RNA Integrity Number）。RINはrRNAをベースにしているためサンプル全体の指標であり、遺伝子（転写産物）単位の指標ではありません。そこで、遺伝子（転写産物）単位の分解度の指標としてTIN（Transcript Integrity Number）が提案されていました（参考記事）。しかしTINは異なる遺伝子に対しても均一な分解を仮定していますが、これは現実的ではないとしてこのDegNormが新たに提案されたようです。確かにFigure 1を見ると、RNA分解による影響は領域によってかなり異なっています。ただしFigure 1eはAlternative splicingみたい。
手法の詳細は正直理解できていませんが、異なるサンプル調整法（ホルマリン固定パラフィン包埋FFPEかfresh frozen）やライブラリ調整法（mRNAセレクトかrRNA除去）で検討している点は評価できます。なんとなく良さげなパッケージな気がします。
Rでパッケージが公開されています（Githubページ）。
